Les fonds figurés viennent très utilement compléter les fonds constitués et les collections de la bibliothèque. La taille, le matériau, la fragilité, la nature même de certains de ces documents exigent des soins particuliers, pour leur classement comme pour leur conservation, et peuvent expliquer que leur communication au public soit parfois restreinte.
Les documents figurés d'origine privée sont classés dans la série FI, dont chaque section est précédée d'un numéro d'ordre. Cependant certains fonds ont été laissé en série J (archives privées) pour des raisons historiques de leur entrée.
Les deux premières conservent les documents isolés, qui y ont été intégrés en fonction de leur taille (sous-série 1FI pour les documents supérieurs à 24 cm sur 30 cm, 2FI pour les plus petits).
À leur suite on trouve les collections de plaques de verre (32FI, d'albums de gravures (14FI) et de photographies (5FI), de représentations du Saint Suaire (21FI), d'affiches (24FI), etc.
Il s'ajoute à ces documents une importante collection de cartes postales, de quelques 12 000 articles (6 à 11FI), où l'on trouvera des vues des communes du Doubs, des paysages de la Franche-Comté et des régions limitrophes, des scènes de la vie politique et quotidienne, des portraits de personnalités comtoises, des reproductions d'œuvres d'art des musées locaux.
À noter que les documents figurés entrés avec les archives publiques restent dans les séries dont relèvent ces archives publiques. Dans certains cas, la mention « plan » a été ajoutée après leur référence : il en est ainsi par exemple des plans extraits de la série H Clergé régulier. Dans d'autres cas (sous-série 1C Intendance de Franche-Comté, par exemple), ils portent la cote de leur liasse d'origine, suivie d'une barre oblique (ex. 1C2308/1).