Pour les archives postérieures à 1940, voir en série W

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Les dossiers des étudiants en médecine, en pharmacie et des élèves sages-femmes ont été versés aux Archives départementales par la faculté de médecine et de pharmacie de l'Université de Franche-Comté le 10 décembre 1997.

Il s'agit uniquement d'un reliquat, le secrétariat de l'École de médecine et de pharmacie ayant subi un incendie en mars 1942, dont nombre de dossiers portent encore la trace.
Les dossiers concernent pour la plupart des étudiants inscrits entre 1897 et la fin des années trente du XXème siècle, même si l'on trouve quelques rares dossiers antérieurs ou postérieurs. Ils sont essentiellement constitués d'une chemise donnant la date et le lieu de naissance de l'étudiant, ses diplômes, la date des inscriptions prises à l'Université, les résultats des examens et la date de l'éventuel transfert du dossier vers une autre université. On y trouve parfois d'autres pièces : livret scolaire de l'étudiant, demandes de dispenses d'âge, de stage, de cumul d'inscriptions, actes de mariage. Les dossiers des pharmaciens mentionnent en outre les officines où l'étudiant a effectué ses stages. Enfin, quelques dossiers contiennent des arrêtés de nomination comme prosecteur, préparateur ou aide d'anatomie et physiologie. Les pièces relatives aux carrières des professeurs ont été systématiquement signalées ci-dessous.