La communauté de Verrières-de-Joux fait partie de la paroisse de Pontarlier. Elle a été érigée en vicariat en 1602.

Administration : comptes de l’église (1612). Vicariat, règlement des droits curiaux : traités entre les habitants de Verrières-de-Joux et les sieurs curés des églises paroissiales de Pontarlier (1660) ; sommation au curé de faire un état des fonds et revenus (1703-1707). Fondation de messes ([XVIIe siècle]-1784). Chapelle du grand autel, collation [fin XVIIe siècle]. Droit d’enterrement dans l’église, acquittement : procès entre les habitants de Verrières-de-Joux et les sieurs Girardet (1717). Confrérie de Saint Éloi, demande d’approbation auprès de l’archevêque de Besançon (1720).